Из Новосибирска до Горно-Алтайска компания S7 Airlines выполняет рейсы по вторникам в 10:50 по местному времени, полёт длится порядка одного часа. Обратно до Толмачево можно улететь в 12:35, прилёт — в 13:40.
Пассажиры из Горно-Алтайска по прибытию в Новосибирск могут, благодаря удобной стыковке с городами продолжить путешествие в Тюмень, Челябинск, Бишкек, Нур-Султан, Москву, Екатеринбург, Красноярск, Омск, Уфу, Санкт-Петербург, Иркутск, Сургут, Нижневартовск и Хабаровск.
Рейсы, вылетающие в Горно-Алтайск, стыкуются в Новосибирске с рейсами, прибывающими из Самары, Красноярска, Нижнего Новгорода, Москвы, Иркутска, Улан-Удэ и Читы.